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承启生物发布超高精度蛋白质测序方案

健闻君健闻君 2022-03-22 268 次 收藏0

(医药健闻2022年3月22日讯)近日,承启生物发布由其首席科学家、暨南大学张弓教授团队研发的一种方便操作、超高精度蛋白质全长测序方案,准确率可达99-100%,刷新了迄今为止的世界纪录。该方案使得蛋白质测序实用化,在生物学、医学、生物安全、法医物证等领域有广阔的应用前景。蛋白质测序的精准化和实用化,在许多领域可以产生前所未有的应用。例如,利用蛋白质测序比核酸测序更快速、更不容易被污染干扰的特点,癌症、老年痴呆等重疾的早筛和诊断将变得更加快捷方便;遇到生物安全事件(如重大疫情)时,蛋白质测序能几个小时内快速锁定病原体,大幅缩短疫情初期明确病原体的周期,为应对疫情争取宝贵时间;抗体药物研发过程中对筛选出的优秀抗体进行直接测序,将可以很快通过合成生物学方法大量生产这种抗体,大大缩短抗体药物的研发周期;蛋白质测序技术也可以轻松破解被国外垄断的蛋白质制剂,大幅度降低药品价格;测定从环境中分离到的具有优异特性的蛋白质,如细菌真菌中降解各种污染物的酶,加以改造和工业应用,可实现绿色环保低碳的发展目标。

张弓教授团队在基因测序方面深耕多年,其全自主开发的FANSe系列核酸测序算法是迄今为止稳健性和准确性最高的比对算法,同时具备很高的容错性。团队将基因组测序中的分步拼接和使用FANSe进行高精度校正的思想移植到蛋白质测序上,对蛋白质质谱分析进行了策略改进,对同一样品的多份质谱数据进行自我比对和校正,最终对蛋白质全长序列的测序准确度达到了空前的99-100%,甚至可以发现买来的标准品蛋白中存在着突变。在不同结构特性的多个蛋白质的测试中,一律能达到近乎完美的全长测序结果,除非质谱仪测不出原始数据。更令人欣喜的是,这个策略甚至能应对质量较差的、有污染的实验数据,同样能稳健地输出准确的结果。实验操作简便,算法也大部分可自动化运行,因此这种方法成本低、速度快、易于推广。

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